Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CK137956B1AYM9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms