Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr16A3KMN5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms