Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf2A3KGV1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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