Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm6880A3KG45 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm6880A3KG45 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6880A3KG45 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm6880A3KG45 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm6880A3KG45 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm6880A3KG45 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms