Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tubb1A2AQ07 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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