Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam43bA2AM80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam43bA2AM80 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fam43bA2AM80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam43bA2AM80 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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