Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Frmpd4A2AFR3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms