Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb4A2A863 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itgb4A2A863 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms