Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calcoco2A2A6M5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms