Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms