Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit3W8DXL4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrit3W8DXL4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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