Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Knop1Q9Z2Q2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Knop1Q9Z2Q2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms