Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn8Q9Z260 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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