Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn13Q9Z0S4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms