Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabbr1Q9WV18 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabbr1Q9WV18 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms