Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mixl1Q9WUI0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mixl1Q9WUI0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mixl1Q9WUI0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms