Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mpdu1Q9R0Q9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mpdu1Q9R0Q9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms