Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms