Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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VapbQ9QY76 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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VapbQ9QY76 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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VapbQ9QY76 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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VapbQ9QY76 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VapbQ9QY76 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms