Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trim44Q9QXA7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim44Q9QXA7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms