Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc2lQ9JME7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms