Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prg4Q9JM99 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prg4Q9JM99 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms