Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rabgef1Q9JM13 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rabgef1Q9JM13 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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