Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CubnQ9JLB4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CubnQ9JLB4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms