Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb3Q9JKS4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms