Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ybx3Q9JKB3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ybx3Q9JKB3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms