Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1fQ9JIS7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms