Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Pgpep1Q9ESW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pgpep1Q9ESW8 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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