Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ms4a4bQ9ES61 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ms4a4bQ9ES61 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ms4a4bQ9ES61 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ms4a4bQ9ES61 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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