Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfrsf23Q9ER63 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms