Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms