Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Bap18Q9DCT6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms