Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms