Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PmpcaQ9DC61 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PmpcaQ9DC61 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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