Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syde1Q9DBZ9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde1Q9DBZ9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms