Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Znf580Q9DB38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf580Q9DB38 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf580Q9DB38 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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