Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prpf4Q9DAW6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms