Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sgf29Q9DA08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms