Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd9Q9D9M4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Pdzd9Q9D9M4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Pdzd9Q9D9M4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Pdzd9Q9D9M4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms