Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms