Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms