Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms