Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ifi35Q9D8C4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ifi35Q9D8C4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms