Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2310002L09RikQ9D7L5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms