Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl40Q9D783 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl40Q9D783 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms