Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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MsraQ9D6Y7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MsraQ9D6Y7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MsraQ9D6Y7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms