Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm5Q9D6G9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms