Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt34Q9D646 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt34Q9D646 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms