Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc81Q9D5W4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms