Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PudpQ9D5U5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PudpQ9D5U5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms